ABD’de New York Şehri Sağlık ve Zihinsel Hijyen Departmanında ve ABD’deki Columbia Üniversitesi’nde Mailman Halk Sağlığı Okulu’nda yürütülen bir çalışma, B.1.526 varyantının bulaşma oranını, bağışıklıktan kaçış yeteneğini ve enfeksiyon ölüm oranını belirlemiştir. Şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2 (SARS-CoV-2).
Bulgular, varyantın daha önce dolaşımda olan varyantlardan önemli ölçüde daha yüksek bulaşıcılık ve bağışıklık kaçış potansiyeline sahip olduğunu ve yaşlı yetişkinler arasında enfeksiyon ölüm oranını %62 – %82 oranında artırabildiğini ortaya koymaktadır. Çalışma şu anda medRxiv * ön baskı sunucusunda mevcuttur.
2019 koronavirüs hastalığı (COVID-19) pandemisinin ilerlemesiyle birlikte, birkaç yeni SARS-CoV-2 varyantı tanımlanmıştır. Artan enfektivite ve patojenite nedeniyle, bu varyantlardan bazıları Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından Endişe Varyantları (VOC) veya İlgi Varyantları (VOI) olarak belirlenmiştir.
Lota varyantı olarak da bilinen SARS-CoV-2’nin B.1.526 varyantı, ilk olarak Kasım 2020’de New York’ta tanımlandı.
Laboratuvar temelli bir çalışmada gözlemlendiği gibi, bu varyant, terapötik monoklonal antikorlar ve aşı/enfeksiyon kaynaklı antikorlar tarafından nötralizasyona orta düzeyde dirençlidir. Buna karşılık, kanıtlar, varyantın aşılanmış veya daha önce enfekte olmuş kişilerde çığır açan enfeksiyon riskini artırmadığını göstermektedir.
Mevcut çalışmada, bilim adamları New York City’de toplanan çok sayıda epidemiyolojik ve nüfus veri setini analiz ettiler ve B.1.526 varyantının bulaşma oranını, bağışıklıktan kaçınma kabiliyetini ve enfeksiyon ölüm riskini belirlemek için matematiksel modelleme gerçekleştirdiler.
Çalışma tasarımı
Bilim adamları, New York’ta SARS-CoV-2’nin iletim dinamiklerini ve nüfus düzeyindeki değişkenleri ve parametreleri tahmin etmek için bir ağ modeli çıkarım sistemi kullandılar. Toplanan bilgilere dayanarak, B.1.526 varyantı için enfeksiyon ve bağışıklıktan kaçınma yeteneği değişikliklerini tahmin etmek için şehir düzeyinde çok değişkenli, yaşa göre yapılandırılmış bir modelleme analizi gerçekleştirdiler. Son analiz, SARS-CoV-2 (enfeksiyon ölüm riski) ile enfekte olan bireyler arasındaki varyanta özgü ölüm oranını tahmin etmek için iki modelden elde edilen verileri kullandı.
Ağ modeli çıkarım sistemi için, aşılama veri kümelerinin yanı sıra çoklu epidemiyolojik veri kümelerini kullandılar. Benzer şekilde, çok değişkenli model analizi, doğrulanmış ve şüphelenilen COVID-19 vakaları, hastaneye yatışlar, ölüm oranları ve New York’ta dolaşan farklı SARS-CoV-2 varyantlarının yüzdesi dahil olmak üzere dört haftalık veri setini kullandı.
Önemli gözlemler
New York’ta, ilk pandemi dalgasının sonunda SARS-CoV-2 enfeksiyonunun nüfus düzeyinde yaygınlığının %16,6 olduğu tahmin edildi. Benzer şekilde, ikinci dalganın sonunda tahmin edilen prevalans %41.7 idi. Enfeksiyonların çoğu birinci dalga sırasında yaşlı popülasyonda ortaya çıkarken, ikinci dalga enfeksiyonları tüm yaş gruplarında neden olmuştur.
B.1.526 varyantının İletilebilirliği ve Bağışıklık Kaçınma Potansiyeli
İkinci pandemi dalgası sırasında B.1.526 ile enfekte vakalarda hızlı bir artış gözlendi. 2020 Kasım ayının başlarında ilk kez belirli bir mahallede varyantın tanımlanmasından önce, aynı mahallede genel SARS-CoV-2 bulaşma hızında kademeli bir artış gözlemlendi. İletim hızı Kasım 2020 ile Şubat 2021 arasında yüksek kaldı, ardından B.1.526 varyantı şehir genelinde baskın hale geldiğinde taban çizgisine bir düşüş geldi. Buna karşılık, diğer mahallelerde iletim hızı sabit kaldı. Genel olarak, bu gözlemler, söz konusu mahalledeki iletim hızındaki artışın muhtemelen B.1.526 varyantının erken hızlı yayılmasından kaynaklandığını göstermektedir.
Toplanan verilerden yapılan tahmin, B.1.526 varyantının aktarım hızının daha önce dolaşımda olan varyantlardan %15-25 daha yüksek olduğunu ortaya koydu. Ayrıca veriler, varyantın popülasyonun %0-10’unda çığır açan enfeksiyonları indükleyebileceğini ortaya koydu. Bulaşabilirlik ve bağışıklıktan kaçınma yeteneğindeki bu ılımlı artışla birlikte, B.1.526 varyantı Kasım 2020’den Mart 2021’e kadar New York City’de baskın hale geldi. Daha sonra, daha bulaşıcı varyant B.1.1.7’nin artmasıyla, B.1.526’nın prevalansı varyant yavaş yavaş azaldı.
Enfeksiyon ölüm riski
Toplu aşılamayı takiben ölüm oranındaki azalmaya rağmen, ikinci pandemi dalgası sırasında New York City’de enfeksiyon ölüm oranında bir indüksiyon tahmin edilmiştir. Bilim adamları tarafından varyanta özgü enfeksiyon ve ölüm oranları hakkında yapılan tahminler, B.1.526 varyantının 45 – 64, 65 – 74 ve 65 – 74 yaşlarındaki bireylerde enfeksiyon ölüm oranlarını % 46, % 82 ve % 62 oranında artırdığını ortaya koymuştur. sırasıyla 75 yaş üstü. Daha önce dolaşımda olan varyantlarla karşılaştırıldığında, B.1.526 varyantı genel olarak enfeksiyon ölüm oranında %60’lık bir indüksiyona neden oldu. Bu indüksiyon, B.1.1.7 varyantı için tahmin edilenle karşılaştırılabilirdi.
Kaynak
Yang W. 2021. Epidemiological characteristics of the B.1.526 SARS-CoV-2 variant, bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2021.08.04.21261596, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.04.21261596v1
